バイオインフォ Kaplan-Meier Plotterの使い方：TCGAデータで生存期間解析を始めよう（ウェブツール）
公開データベースを利用して、がんにおける遺伝子の発現と予後の関係を調べるには、どのようにしたら良いでしょうか。TCGAの公開データをダウンロードして、Rや統計ソフトを使ってデータの処理と解析を行えば調べることができますが、専門的な知識と技術...
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レジデント 【ペライチ論文要約】15分で概要をつかむ論文の読み方（臨床研究）
臨床研究の論文は、コツを掴めば15分程度で最低限の内容を理解し、後から見直せるメモまで残すことができます。初心者でも、すぐに読めるようになります。「抄読会で論文を読んで準備をしないといけない」、「診療や研究で必要な論文をいくつも読まないとい...
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バイオインフォ 初級編 RStudioの使い方（インストールから実践まで）
Rを使う際に必ずインストールしておいた方がいいアプリ「RStudio」について紹介します。初めてRを使う方は、「Rだけでも精一杯なのに、RStudioまで使うなんで厳しいです」と思うかもしれませんが、心配ありません。むしろ、Rをより簡単に使...
バイオインフォ Rで遺伝子変異のwaterfall plotを描く（GenVisR）
DNA sequenceの結果から、遺伝子変異を分かりやすい図にまとめる方法として、Waterfall plotがあります。Rでどのように描くか、実際にやりながら学んでみましょう。はじめに複数の腫瘍検体のsequenceを行った際に、遺伝子...